Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms