Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm6871L7N248 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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