Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20878L7N244 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms