Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms