Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm8888J3QPX5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm8888J3QPX5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm8888J3QPX5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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