Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm21900J3QP38 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21900J3QP38 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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