Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm21976J3QNN2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21976J3QNN2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms