Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm20918J3QN17 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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