Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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