Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms