Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf4bG5E8Z2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf4bG5E8Z2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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