Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf148G3X9R7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms