Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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