Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5160F8VPN3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms