Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms