Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3443F7CCV5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3443F7CCV5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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