Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm8005F6YKY3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm8005F6YKY3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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