Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm10378F6XQQ1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm10378F6XQQ1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10378F6XQQ1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm10378F6XQQ1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10378F6XQQ1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10378F6XQQ1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10378F6XQQ1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10378F6XQQ1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10378F6XQQ1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm10378F6XQQ1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm10378F6XQQ1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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