Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms