Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms