Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
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