Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms