Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms