Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms