Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc170D3YXL0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc170D3YXL0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc170D3YXL0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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