Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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