Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm17333C6EQI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms