Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms