Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms