Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rd3lB2RV38 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms