Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms