Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt4B2RU40 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms