Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms