Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Col4a6B1AVK5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a6B1AVK5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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