Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms