Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms