Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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