Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6880A3KG45 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm6880A3KG45 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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