Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms