Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms