Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lcn6A2AJB9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn6A2AJB9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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