Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm13941A2AJ38 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm13941A2AJ38 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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