Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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