Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm4T1NXB5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms