Protein–RNA interactions for Protein: S4R185

Gm26938, Predicted gene, 26938 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26938S4R185 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm26938S4R185 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm26938S4R185 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm26938S4R185 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm26938S4R185 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm26938S4R185 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm26938S4R185 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm26938S4R185 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm26938S4R185 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm26938S4R185 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms