Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms