Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Crlf3Q9Z2L7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms