Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdpk1Q9Z2A0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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