Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cldn3Q9Z0G9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cldn3Q9Z0G9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cldn3Q9Z0G9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cldn3Q9Z0G9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cldn3Q9Z0G9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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