Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nme3Q9WV85 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms